Veo que el tema de la recopilación de software está un poco parado, y es una pena. Yo ya usé este listado unas cuantas veces como consulta.
Consultando varios post vi que aparecían estos programas que me parecen interesantes:
Estudio de movilidad general: Vissum y Vissim
Riesgos ambientales: CAMEO, ALOHA, SCREE, TANKS, RISK, SCRI, SCREEN, Era Toolkit
Ruido: IMMI, Sound Plan, Lima
Contaminación del tráfico rodado: COPERT 4
Eficiencia energética en edificios: LIDER, CALENER, DESIGNBUILDER, ECOTECT
Teledetección: multiSpec, Leoworks,
Contaminación atmosférica: Aermod, calpruff
PRL: Urbicad, Construbit, SEnmut
Espero que sirvan de algo