Hola,
Se me ocurre, de primeras, a la Consejería de Medio Ambiento, por escrito. Plantea el problema, vuestras quejas, y solicita autorizaciones, permisos, controles, etc. de la planta. Por escrito, insisto.
Otra es el Ayuntamiento, pero si es pequeño, igual no teneis nada que hacer.
En casos urgentes y peligrosos, puedes tirar del mismo SEPRONA, que si ven indicios de alguna irregularidad, podrán tomar medidas y remitir el caso al juzgado/Administración.
Saludos.